Trzeba odróżniać dwie rzeczy. Numer generacji raportu i wersję.
Zmiana id instalacji wpływa na to, że można stosować numer generacji jaki chcemy. Jeżeli w starym id instalacji masz numer 3123 to w nowym id instalacji możesz zacząć od 1 zamiast kontynuować od 3124.
Wersja to coś co nie zmienia się względem id instalacji i musi być zawsze wyższa. Zwykle to jest coś na co trzeba zwracać uwagę przy migracjach, więc trzeba albo sprawdzić jaki był ostatnio numer wersji i kontynuować albo wysłać raport ze starego programu z wersją 999 oraz usun=T i można wtedy zacząć od nowa od 1.
Zmiana id instalacji to coś co nie jest takie łatwe. W oddziałach z Portalem a nie z SZOI musisz zawnioskować do NFZ o przydzielenie nowego id instalacji. W oddziałach z SZOI sam sobie wymyślasz identyfikator i nie musisz tego nigdzie zgłaszać. Ale tak czy inaczej zmiana id instalacji może spowodować potem perturbacje przy poprawkach już wysłanych raportów statystycznych itp. Zwykle zmieniasz id instalacji całościowo a nie tylko wobec raportu LIOCZ. Wszystko zależy od tego czy Twój program do rozliczeń obsłuży taki scenariusz, że od dzisiaj masz nowy id instalacji, ale jak zrobisz poprawki wstecz to system wyśle je z tym id instalacji, który był pierwotnie kiedyś zastosowany.