Na temat zabezpieczeń kopii baz można by napisać książkę. Koniecznie powinieneś przechowywać bazę poza serwerem, w przypadku uszkodzenia maszyny i tak wszystko pójdzie do diabła.
Nagrywanie na płytki jest niezłym pomysłem, rozważ również dysk przenośny podłączany tylko na czas przegrania nowych plików, resztę czasu powinien leżeć zabezpieczony w sejfie/zamykanej szafie.
To najtańsze rozwiązanie, trochę droższe to np. pamięć dyskowa NAS, na którą kopie danych z komputerów będą automatycznie odkładane. Również takie urządzenie nie powinno stać w jednym pomieszczeniu z serwerem, bo w razie np. pożaru i tak tracisz wszystko.